Polskie Towarzystwo Urologiczne podejmuje współpracę z wieloma organizacjami naukowymi i prozdrowotnymi.

Polskie Towarzystwo Andrologiczne (PTA) Polskie Towarzystwo Ginekologów i Położników (PTGiP) Polskie Towarzystwo Onkologiczne (PTO) Polskie Towarzystwo Uroginekologiczne (PTUG) Stowarzyszenie Pielęgniarek Urologicznych European Association of Urology (EAU) American Urological Association (AUA) European Board of Urology (EBU)